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          小鼠ENCODE突破

          2015年05月27日 15:00:13人氣:530來源:上海研生生化試劑有限公司

          由冷泉港實驗室(CSHL)的Thomas R. Gingeras和西班牙巴塞羅那基因組調(diào)控中心的Roderic Guigo*的一個研究小組,鑒別出了人類和小鼠中表達水平在相對限制的范圍內(nèi)變化的6600個基因。
          他們發(fā)現(xiàn),這種表達限制與它們基因序列的相似程度無關(guān)。不論細胞的類型,這6600個基因代表了在兩個物種的全部組織細胞中通?;罨恼谆蛑写蠹s三分之一的基因。研究人員說,這項研究提供的新信息將繼續(xù)幫助使小鼠成為研究人類疾病和生物學的*模式生物。

          Gingeras說:“我們發(fā)現(xiàn),進化相當狹窄地限制了這6600個基因的表達水平,我們認為這反映了這些特殊的基因?qū)τ趦蓚€物種中所有組織中所有細胞的運作均至關(guān)重要。進化告訴了我們:不管在何種細胞類型中表達,這些基因需要限制它們的表達變化——變化增大將會高度損害基本的細胞日常運作。細胞需要這些基因在一個相對狹窄的范圍內(nèi)運轉(zhuǎn)確保正常地發(fā)揮功能?!?br>該研究小組鑒別出的這6600個基因在小鼠和人類中已進化至,不論是在乳腺組織或肺組織中;也不論是在上皮細胞或神經(jīng)細胞中,其表達在大約100倍的范圍內(nèi)變化。而剩余的三分之二的表達基因則能夠在10萬倍以上的范圍改變它們的表達。

          此外,Gingeras和合作者們還發(fā)現(xiàn)當比較從雞到人類6種極為不同的動物物種時,它們?nèi)匀还餐?500個基因的表達嚴格地限制在相同的狹窄范圍內(nèi)??茖W家們說,這表明了這種調(diào)控機制在進化上非常古老,因此極為重要。

          這些出現(xiàn)在《自然》(Nature)雜志的一篇研究論文中,并且當前公布在生命科學預(yù)印本biorxiv.org上的研究結(jié)果,是小鼠ENCODE(DNA元件百科全書)項目在幾家科學期刊上發(fā)布的大量研究工作的一個組成部分。這一團體在今天發(fā)布于《自然》(Nature)雜志上的4篇研究論文中報告了一些共享研究結(jié)果。這項研究工作調(diào)查了參與調(diào)控小鼠和人類基因組的一些遺傳和生物化學程序。

          同時,該團體還發(fā)現(xiàn)了一些強有力的線索解釋為什么小鼠中的一些過程和系統(tǒng),例如免疫系統(tǒng)、代謝和應(yīng)激反應(yīng)會與人類如此的不同?;诙嗄甑男∈蠛突蛘{(diào)控研究,他們開發(fā)出了一種資源來幫助科學家們更好地理解小鼠和人類之間的相似和不同之處如何書寫在它們的基因組中。
          這些研究結(jié)果有可能從整體上提供了,有關(guān)基因調(diào)控和對哺乳動物生物學至關(guān)重要的其他一些系統(tǒng)的新見解。他們還提供了一些新信息確定何時以及在哪些細胞類型和組織中,小鼠是研究人類生物學和疾病的適當模型,并且有可能幫助解釋它的某些局限性。這事實上是Gingeras和同事們在新論文中報告的這項研究工作的意義之一。

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