精確DNA甲基化測序技術(shù)可應(yīng)用于高通量測序平臺（如全基因組甲基化測序oxWGBS、簡化的甲基化測序oxRRBS等常規(guī)測序技術(shù)）；Infinium 450 K芯片檢測平臺；焦磷酸測序和靶基因檢測等不同平臺。對于全面研究胚胎發(fā)育、衰老機制、疾病發(fā)生發(fā)展的表觀遺傳機制和篩選疾病相關(guān)的甲基化標(biāo)記位點具有重要的意義。

精確DNA甲基化測序技術(shù)

數(shù)據(jù)解讀分析內(nèi)容

1. 基本數(shù)據(jù)處理
   • 原始數(shù)據(jù)評估，去除接頭與過濾低質(zhì)量數(shù)據(jù)；
   • reads數(shù)量以及數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計。
2. 基礎(chǔ)生物學(xué)信息分析
   • 將測序數(shù)據(jù)與參考基因組比對，統(tǒng)計比對結(jié)果；
   • 基于比對結(jié)果，統(tǒng)計各C位點的甲基化修飾信息；
   • 測序數(shù)據(jù)的堿基覆蓋深度及覆蓋度統(tǒng)計；
   • 胞嘧啶（CG、CHG、CHH）甲基化水平統(tǒng)計；
   • 基因組甲基化分布及修飾特征分析；
3. 高級生物學(xué)信息分析
   • 結(jié)合項目背景的差異甲基化修飾位點(DMS)的鑒定、注釋和分布分析；
   • 結(jié)合項目背景的差異甲基化修飾區(qū)域(DMR)的鑒定、注釋和分布分析；
   • 結(jié)合項目背景的差異甲基化修飾基因的功能、通路和疾病等富集分析；
   • 結(jié)合項目背景，與其他多組學(xué)數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)分析。

樣本要求

1. 樣品類型：無降解，無污染的DNA樣品；
2. 樣品需求量：≥3μg；單個樣品構(gòu)建2個不同的文庫；
3.  樣品濃度：≥30 ng/μl;
4. 樣品純度：OD260/280=1.8~2.0