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          上海道寧信息科技有限公司

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          snapgene
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          • 所在地

          訪問次數:479更新時間:2021-08-25 20:53:37

          聯系我們時請說明是智能制造網上看到的信息,謝謝!
          產品簡介
          snapgene 產品編號:132535 當前版本: 開 發(fā) 商:GSL Biotech 產品類型:應用軟件類型 產品功能:生物學制圖 開發(fā)平臺:Visual ......
          產品介紹
          •  產品介紹:

            SnapGene 是一個直觀允許用戶分析和修改 DNA圖譜的應用程序,并將它們導出到其他 fomats.由于這個軟件,分子生物學家有可能使,探索或共享共享詳細的 DNA 序列文件.

            產品功能

            1.可視化

            DNA可視化

            查看DNA序列的多個視圖。


            地圖 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 歷史

            自定義酶位點,特征,引物,ORF,DNA顏色等的顯示。地圖可以是圓形或線性格式。

            支持大序列

            瀏覽染色體大小序列。





            查看 · 搜索 · 縮放

            利用SnapGene的高效數據處理功能,掃描具有數千種注釋功能的大型DNA序列。

            蛋白質可視化

            查看蛋白質序列的多個視圖。



            地圖 · 序列 · 屬性 · 特征 · 歷史

            自定義區(qū)域,站點,鍵和序列顏色的顯示。


            直觀的序列編輯

            輕松編輯DNA和蛋白質序列。


            標準編輯 · DNA結束

            進行插入,刪除,替換和大小寫更改。復制并粘貼序列時,會自動傳輸功能。

            序列顏色編碼

            將選定的DNA或氨基酸序列設置為十種顏色之一。

             

            給兩條DNA鏈或蛋白質序列著色。顏色在Map和Sequence視圖中都可見。

            特征注釋

            自動注釋常用功能,或手動注釋新功能。


            自動特征檢測 · 手動特征注釋

            使用SnapGene廣泛的數據庫查找DNA序列中的常見特征。您選擇的其他功能可以添加到自定義數據庫中。

             

            2.模擬

            限制性站點指標

            確認限制性網站適合克隆。



            *性 · 甲基化敏感性 · 特殊性質

            以粗體顯示*的限制性位點,或選擇自動定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。

            限制性克隆

            可視化克隆過程的所有方面。

             

            如果您已經考慮過程,則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過程存在設計缺陷,則可以捕獲并糾正錯誤。

            PCR

            模擬標準PCR。

            使用您自己的引物,或要求SnapGene自動設計引物。產品文件在其歷史記錄中存儲模板和引物。

            重疊延伸PCR

            通過重疊延伸PCR融合片段。

             

            多可組裝八個片段。選擇要連接的片段及其方向,SnapGene將設計引物。

            引物定向誘變

            使用誘變引物進行定點誘變。

             

            選擇誘變引物,按下按鈕查看修飾的質粒。歷史顏色突出了突變。 

            網關®克隆

            模擬網關® BP克隆或LR克隆,或兩者在同一時間。

             

            為方便起見,提供了常見的供體向量和目的向量。選擇要組裝的片段,SnapGene將設計引物。

            吉布森大會®

            通過融合多達八個片段或通過將多達八個片段插入向量來模擬Gibson Assembly。Gibson Assembly是一種流行的無縫克隆方法。

             

            選擇要融合的片段及其方向,SnapGene將設計引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產生。

            IN-FUSION ®克隆

            通過在向量中插入 多八個片段來模擬Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一種非常通用的方法,可用于創(chuàng)建無縫基因融合。

             

            選擇要融合的片段及其方向,SnapGene將設計引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產生。

            TA和GC克隆

            通過TA或GC克隆捕獲PCR產物。

             

            選擇傳統的TA克隆或高效GC克隆。

            為方便起見,提供了常見的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。

             

            退火Oligos

            退火兩個寡核苷酸形成雙鏈產物。使用簡單的控件添加突出限制克隆

             

             3.規(guī)避錯誤

             

            閱讀基因融合的框架

            確保構造中的已轉換要素符合框架。使用序列視圖可以快速查看兩個已翻譯的要素是否在框架中。如果是這樣,翻譯鏈接在同一行。如果不是,則翻譯在單獨的行上。

            與參考序列對齊

            使用強大的對齊工具檢查實際構造是否與模擬構造匹配。

             

            4.自動錄制

            全面的撤銷能力

            幾乎撤消任何操作。不要害怕嘗試使用SnapGene文件 回溯您的步驟很容易。

            歷史和嵌入式祖先

            查看構造的圖形歷史記錄。單擊操作以突出顯示親本和產物序列的相關部分,或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。

            單擊歷史記錄樹中的祖先以重新生成該祖先序列文件,包括其注釋和克隆歷史記錄。

            歷史色彩

            使用可選的歷史記錄顏色來標識序列的 新更改。

             

            5.數據

            安全文件管理

            SnapGene文件保存在所需的位置。使用熟悉的安全操作系統來存儲和整理SnapGene文件。

            從其他格式導入

            閱讀許多常見的文件格式。不僅可以導入DNA序列,還可以導入注釋和注釋。我們將繼續(xù)開發(fā)進口商,以確保您不會被鎖定為專有文件格式。

            導出為標準格式

            將序列,地圖或凝膠圖像轉換為標準格式,以便與其他軟件一起使用。將序列導出為GenBankFASTA格式。將地圖或模擬瓊脂糖凝膠導出為常見的圖像格式。

            使用SnapGene Viewer共享數據

            SnapGene格式的文件發(fā)送給可以下載免費SnapGene Viewer的同事或客戶。只需將文件與鏈接一起發(fā)送到SnapGene Viewer即可。收件人將能夠看到地圖,序列和注釋,就像在完整的SnapGene界面中一樣。

             

            6.轉換文件格式

            開放式信息交換至關重要,因此SnapGeneSnapGene Viewer提供了讀取和導出常見文件格式的選項。

            從其他格式導入時,目標不僅是捕獲DNA序列,還捕獲注釋和注釋。


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