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          全基因組甲基化測序技術(shù)(WGBS)

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          • 所在地 深圳市

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          更新時間:2018-10-09 10:20:34瀏覽次數(shù):1674

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          產(chǎn)品簡介

          全基因組甲基化測序技術(shù)(WGBS)可以在全基因組范圍內(nèi)檢測所有單個胞嘧啶堿基(C堿基)的甲基化水平。能為基因組DNA甲基化時空特異性修飾的研究提供重要技術(shù)服務(wù),能廣泛應(yīng)用在個體發(fā)育、衰老和疾病等生命過程的機(jī)制研究中,也是各物種甲基化圖譜研究的優(yōu)選方法。

          詳細(xì)介紹

          全基因組甲基化測序技術(shù)(WGBS)可以在全基因組范圍內(nèi)檢測所有單個胞嘧啶堿基(C堿基)的甲基化水平。能為基因組DNA甲基化時空特異性修飾的研究提供重要技術(shù)服務(wù),能廣泛應(yīng)用在個體發(fā)育、衰老和疾病等生命過程的機(jī)制研究中,也是各物種甲基化圖譜研究的優(yōu)選方法。可應(yīng)用于稀有樣本,如胚胎細(xì)胞、腫瘤干細(xì)胞等的全基因組甲基化研究。

          全基因組甲基化測序技術(shù)(WGBS)常規(guī)起始量WGBS:運(yùn)用約1微克的基因組DNA進(jìn)行文庫構(gòu)建和重亞硫酸鹽處理。可根據(jù)物種基因組大小和測序數(shù)據(jù)量增加構(gòu)建文庫的個數(shù),減少測序bias,確保甲基化檢測的準(zhǔn)確性。

           

          數(shù)據(jù)解讀分析內(nèi)容

          1.數(shù)據(jù)產(chǎn)出、過濾和質(zhì)控

               。下機(jī)數(shù)據(jù)過濾和質(zhì)控圖表

          2.數(shù)據(jù)比對、甲基化信息

              。比對結(jié)果、Bisulfite轉(zhuǎn)化率統(tǒng)計

               。覆蓋度以及覆蓋深度統(tǒng)計

               。甲基化修飾位點及水平結(jié)果

          3.甲基化修飾特征                      .

                。甲基化修飾位點和水平的特征及統(tǒng)計

          4.差異甲基化修飾區(qū)域

                。差異甲基化修飾區(qū)域(DMR)的鑒定和注釋

          5.差異甲基化修飾基因

                 。差異甲基化修飾基因功能和通路分析

          樣本要求

          1. 樣品類型:無降解,無污染的DNA樣品;
          2. 樣品需求量:≥2μg;
          3.  樣品濃度:≥30 ng/μl;
          4. 樣品純度:OD260/280=1.8~2.0

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